16.05.2011 г. на сайт пришло 2561 человек, открывших 3205 страниц 14.11.2011 г. на сайт пришло 2106 человек, открывших 3250 страниц 14.12.2011 г. на сайт пришло 2640 человек, открывших 3452 страниц 17.01.2012 г. на сайт пришло 2439 человек, открывших 3097 страниц 03.03.2012 г. на сайт пришло 2219 человек, открывших 3019 страниц 30.05.2012 г. на сайт пришло 3512 человек, открывших 4706 страниц 06.03.2014 г. на сайт пришло 2556 человек, открывших 3179 страниц 08.02.2015 г. на сайт пришло 2341 человек, открывших 2682 страницы Если приходят, значит полезное находят.. Наш адрес: |
Выбрав любое изображение, кликните по нему мышкой, и Вы узнаете о статистике ...
|
На файле "Поиски методов или результатов статистического анализа" сообщается, что сейчас на сайте БИОМЕТРИКА размещено 4162 htm-файлов, 651 pdf-файлов, 152 djvu-файлов, и т.д. И там же приводятся описания групп конкретных файлов. В частности по методам статистического анализа, их отличным результатам, отзывам авторов, книгам этих методов, статистике посещаемости сайта БИОМЕТРИКА, и т.д. Далее приведено подробное пояснение поиска нужных файлов системой Google, которая там же и помещена. А после системы Google размещены популярные 341 htm-адресов и 79 адресов pdf-адресов. Итак, для оперативного выбора конкретного нужного файла на данном сайте БИОМЕТРИКА , рекомендую перейти на файл "Поиски методов или результатов статистического анализа". |
Логистическая регрессия в медицине и биологии В. Леонов Логистическая регрессия. Введение.
В данной серии статей, на уровне доступном для начинающих, рассмотрены цели и направления метода логистической регрессии. В частности, приводятся пояснения, какие надёжные результаты этого метода могут быть использованы для поставленных целей медицинских и биологических исследований. На примерах реальных медицинских массивов данных, поясняется специфика использования данного метода. Объяснено, что метод имеет много алгоритмов оценки уравнений логистической регрессии, что позволяет назходить для использования во врачебной практике самые удобные и надёжные методы лечения. Рассмотрено использование метода к массивам данных, содержащим несколько сотен признаков разной природы. Показано, что корректное создание таких массивов, и их анализ, возможны лишь при участии биостатистиков на самых первых этапах таких исследований. Рассмотрена связь логистической регрессии и ROC-анализа. Приведены многочисленные уравнения логистической регрессии и ROC-кривые, полученные при анализе реальных данных. Объяснена целесообразность использования вместе с методом логистической регрессии набора методов анализа парных взаимосвязей между различными признаками, а также использование более сложных методов многомерной статистики. Логистическая регрессия.
Научное изучение всех явлений,
N.B.! Перед чтением данной статьи, настоятельно рекомендуем прочитать статью "Логистическая регрессия. Введение"
Наиболее интересны, и в то же время
наиболее сложны и трудоёмки, оценки уравнений логистической регрессии для
массивов большой размерности, т.е. для данных, содержащих по несколько сотен
переменных. С двумя примерами анализа таких объёмных матриц можно познакомиться
в статьях «Логистическая регрессия в анализе связи артериальной гипертонии и
психических расстройств». Н.П.Гарганеева, В.П.Леонов. Сибирский
медицинский журнал, № 3-4, 2001, с.42-48. (http://www.biometrica-tomsk.ru/lib/psycho3.htm ) и «Артериальная гипертония как
психосоматическая проблема». Н.П. Гарганеева, Ф.Ф. Тетенев, В.Я. Семке,
В.П. Леонов. Клиническая медицина, № 1, 2004, с. 35-41 (http://www.biometrica-tomsk.ru/lib/psycho2.htm ).
Рассмотрим
несколько таких массивов и обсудим специфику работы с ними. Первый массив, созданный Евдокимовой Т.А. при изучении аллергии, содержит
более 1200 наблюдений и более 400 признаков. Ниже приведён перечень этих
признаков.
Как видим, примерно половина признаков являются качественными, другая половина – количественными. Тактика анализа таких массивов данных определяется целями исследования и тем, каким образом предполагаются использовать полученные в исследовании результаты. Обычно такие полноценные массивы данных бывают «долгоиграющими», т.е. используемыми не только для разового анализа с целью защиты докторской или кандидатской диссертации, а подвергаются статистическому анализу многократно в течение нескольких лет с помощью различных методов. Это вызывается тем, что по мере получения результатов анализа таких массивов, возникает желание проверить новые гипотезы изучаемых механизмов развития и течения того или иного заболевания, уточнить ряд деталей, которые первоначально казались несущественными, разработать несложный алгоритм практического использования полученной модели и т.д. И это абсолютно верная и правильная тактика работы с подобными массивами. Поскольку такие массивы данных содержат огромные объёмы информации, которые извлекаются из них путём последовательного применения различных методов анализа. Типичным примером такого исследования является всемирно известное Фремингемское исследование - Framingham Heart Study. Обычно программы работы по анализу подобных массивов данных включают
порядка 50-100 пунктов. Предварительный анализ описанного выше массива по
аллергии позволил получить для зависимых признаков VAR1A="проблемы при
употребл. молока" и VAR4A="Проблемы при употреблении яиц"
порядка десятка уравнений, с величиной показателя конкордации в интервале
85-95%.
Как уже
говорилось выше, принципиальное отличие многомерных методов от других методов
анализа заключается в использовании информации о взаимных связях анализируемых
признаков. Предположим, что из представленных выше признаков наибольший интерес
представляют 200 количественных признаков, и 210 дискретных, качественных признаков. Из них 10 качественных признаков будем
считать выходными, для которых необходимо оценить уравнения логистической
регрессии. Для упрощения обозначим дискретные, качественные признаки буквой D, и далее
номер по порядку, например, D1, D2, …, D200. Количественные же признаки обозначим аналогичным образом через
К1, К2, …, К200. А зависимые качественные признаки
обозначим как Z1, Z2, …, Z10.
В этом случае для каждого зависимого признака Zj можно использовать в качестве потенциальных предикторов самые разные наборы исходных переменных. Например, только 200 качественных переменных. Или же только 200 количественных признаков. Или все качественные и все количественные признаки. Однако в любом случае для понимания и интерпретации, получаемых при этом уравнений, необходимо изучить все парные взаимосвязи. Причём такое изучение не должно ограничиваться только анализом тех пар, в которых в качестве одного члена такой пары обязательно присутствует зависимый признак. Поскольку включение предикторов в уравнение базируется не только на использовании значимых связей между зависимой переменной и одной качественной или количественной, но и на использовании парных связей между отдельными качественными и отдельными количественными предикторами. Применительно к нашему случаю это означает, что не следует ограничиваться только анализом связи между 200 парами качественных признаков вида Z1 – D1, Z1 – D2, …, Z1 – D200, или вида Z1 – K1, Z1 – K2, …, Z1 – K200. Но необходимо также исследовать все парные связи вида Di – Dj, Ki – Kj, Ki – Dj. Оценим для данного набора количество подобных парных связей, которые необходимо проанализировать. Начнём с дискретных качественных признаков. Для 200 качественных признаков число анализируемых пар составит 200*(200-1)/2=100*199=19900. Такое же число парных связей будет и для количественных показателей. Сюда же следует для каждой зависимой переменной Zi добавить ещё 400 парных связей вида Zi – Dj и Zi – Kj. Отметим, что такой анализ, помимо его важности для интерпретации
логистических моделей, имеет ещё и собственную колоссальную важность, поскольку
он даёт огромное количество ценной информации о наличии или отсутствии
взаимосвязей внутри многих пар признаков. Эта информация позволят более полно и
осмысленно представить всю картину изучаемого явления. Для
иллюстрации описанных выше оценок рассмотрим пример, в котором использованы
всего лишь 7 потенциальных предикторов и одна зависимая переменная. Предположим, что исходя из результатов ранее выполненных исследований, модель
изучаемого процесса может быть представлена в виде одной зависимой переменной Z, а также
двух уровней потенциальных предикторов. В первом уровне имеется 4 предиктора (2
количественных – К1 и К2, и 2 дискретных – D1 и D2). Во втором
уровне имеется 3 потенциальных предиктора (2
количественных – К3 и К4, и 1 дискретный – D3).
На рис. 1
стрелками представлены возможные парные связи между этими признаками. Число
парных связей внутри 1-го уровня равно [4*(4-1)/2]=6. Число парных связей
внутри 2-го уровня равно [3*(3-1)/2]=3. Число парных связей между 1 и 2
уровнями равно 4*3=12. И число парных связей между зависимой переменной Z и
предикторами 1 и 2 уровней равно соответственно 4 и 3. Итого мы имеем 28 парных
связей. Эту же самую оценку можно получить и иным способом: 8*(8-1)/2= 28, (где
8 – общее число анализируемых признаков). Несложно аналогичным образом
подсчитать число тройных связей, в каждой из которых обязательно должен
присутствовать зависимый признак Z.
Почему
необходим анализ всех этих парных связей? Современные алгоритмы оценки
уравнения логистической регрессии используют наиболее продуктивные пошаговые
процедуры. При этом на каждом шаге такой процедуры может включаться один
предиктор. Включение такого предиктора не обязательно может быть обусловлено
наличием связи между зависимой переменной Z с этим
предиктором, а наличием значимых связей между предикторами уже включёнными в
уравнение, и предикторами-кандидатами на включение. Тщательный анализ шагов
позволяет оптимизировать состав предикторов, добиваясь этим повышения качества
модели, в частности, путём максимизации такого показателя, как процент
конкордации.
При создании
таких серьёзных массивов данных обязательно необходимо участие в их разработке
профессиональных биостатистиков, причём уже на самых первых этапах формирования
признакового пространства, а также формирования числа градаций качественных
признаков. В качестве примера игнорирования этого требования приведу фрагменты недавней переписки.
31 мая 2011
г. я получил письмо следующего содержания.
«Уважаемый
Василий Петрович!
Я пишу Вам
по совету профессора А.М. Чернявского из НИИ Патологии Кровообращения имени Е.Н. Мешалкина г. Новосибирск. В нашем институте три недели назад официально
начато Российское рандомизированное многоцентровое клиническое исследование
влияния различных методов хирургической коррекции ишемической митральной недостаточности в сочетании с коронарным шунтированием на течение сердечной недостаточности и состоятельности коррекции митрального клапана. Это исследование
официально зарегистрировано на сайте
www.clinicaltrials.gov, как "ХИРУРГИЧЕСКОЕ ЛЕЧЕНИЕ ИШЕМИЧЕСКОЙ МИТРАЛЬНОЙ НЕДОСТАТОЧНОСТИ" (Surgical Treatment of Ischemic Mitral rEgurgitation – “TIME”). Это большое исследование, рассчитанное на три
года, в которое уже на начальном этапе согласились войти и начали работать по
общему протоколу кардиохирургические центры Екатеринбурга,
Иркутска, Красноярска, Кишинёва, Москвы, Перми. Создана база больных, в которую
вносятся данные из всех центров. В базе более 900 (!) переменных. В дальнейшем
мы планируем обратиться к Вам для профессионального статистического анализа
полученных данных. Но сейчас, пока работа по набору материала только началась,
мы просим Вас, как большого профессионала в данной области, дать некоторые
советы по возможному изменению базы данных и количества пациентов, которые
будут принимать участие в данном исследовании. В прикреплённых файлах Вы найдёте протокол исследования и базу данных.
Заранее благодарен, если Вы найдёте время помочь нам!
С уважением, Рузматов Тимур»
Вместе с приведённым выше письмом автор прислал документ из 8
страниц, озаглавленный как «Протокол российского клинического многоцентрового
исследования». В разделе 1.5 этого документа, сообщалось следующее. «Четыреста
двадцать (420) пациентов мужского и женского пола в возрасте от 30 до 75 лет с
клиническим диагнозом … , которым планируется … , будут включены в исследование и получат …
лечение». Внимательное изучение этого документа не привело к обнаружению хоть
каких-то намёков на то, какие же конкретно гипотезы и какими статистическими
методами организаторы этого исследования планируют проверять. А ведь именно для
этого в медицинской науке и создаются подобные базы данных.
Из переписки с Т. Рузматовым выяснилось, что при организации данного
исследования и формировании базы данных биостатистик не привлекался. Более
того, при организации этого масштабного, и без сомнения необходимого
многоцентрового исследования, руководители исследования вообще не запланировали
этап статистического анализа этой базы данных и, соответственно, его
финансирование. Такое отношение организаторов исследования к создаваемой базе
данных не может не удручать. Фактически это означает, что затратив миллионы
рублей на создание этой базы данных, из неё будет извлечена лишь самая примитивная
информация. Причём ещё неизвестно, насколько корректно это будет сделано. Можно
сказать, что такое формирование подобных баз данных есть наглядная
иллюстрация подхода «Давай, Давай, – Потом Подумаем» и неуважения к биостатистике и к тем, кто занимается этой наукой (см. наши статьи «Общие проблемы применения статистики в
биомедицине или что разумнее: ДДПП или ДППД?»
URL: http://www.biometrica-tomsk.ru/problem.htm и «Искушение Знанием или Сколько стоит
биометрика?» URL: http://www.biometrica-tomsk.ru/price_biom.htm).
Обстоятельства сложились так, что в начале 2011 г. автор этих срок некоторое время находился в этом самом НИИ. Будучи там
я предложил зам. директора НИИ по науке профессору А.М. Ч. прочитать для
сотрудников этого НИИ лекцию о современных возможностях биостатистики и
типичных ошибках её использования в медицинской науке. Увы, оказалось,
что лекция не нужна. Как не нужно и предложенное статистическое рецензирование
статей в издаваемом в этом НИИ журнале. И это при том, что в этих статьях, и в диссертациях,
защищаемых сотрудниками этого НИИ, те же самые ошибки, что и в кузбасских
публикациях (http://www.biometrica-tomsk.ru/kuzbass1.htm ). О чём говорит такое отношение руководителей медицинской
науки к биостатистике? Как минимум, об отсутствии у них знаний об эффективности
современных методов биостатистики. И, соответственно, неэффективности создания
подобных баз данных и их дальнейшего анализа без участия биостатистиков. В
результате наша переписка с Т. Рузматовым закончилась тем, что я порекомендовал убедить
руководителя этого исследования привлекать профессиональных биостатистиков ещё
на этапе планирования подобных исследований, и увеличить объём базы данных в
несколько раз. Ответа на эти предложения я не получил…
Для демонстрации неэффективности работы с базами данных, в которых
количество признаков превышает объём наблюдений, рассмотрим
следующий пример, построенный на реальной базе данных, подобной той, которую
планируют создать организаторы упомянутого выше исследования.
Ниже приведены признаки проанализированной базы данных, созданной исследователем Н.С. из Якутска при исследовании проблем в области акушерства.
В качестве зависимого признака выступает переменная VAR15A =«Течение родов», имеющая три градации: 1 - самопроизвольные, 2 - программированные, 3 – оперативные. Из исходного массива данных путём случайного отбора (равномерный закон распределения) отбиралось 10 подмассивов, объёмы которых были в 2 раза меньше, чем количество переменных. После чего по этим подмассивам оценивались 10 уравнений логистической регрессии. Сравнение 10 полученных уравнений показало различие их структуры. В частности, наблюдалось отличие уравнений по составу предикторов. Помимо этого, в тех уравнениях, в которых были одинаковые предикторы, в большинстве случаев различались знаки коэффициентов для одних и тех же предикторов. В то же время для всех уравнений значения показателя конкордации были весьма велики, от 95 до 99%. Далее производилась следующая процедура. В каждый подмассив данных после оценки уравнений, добавлялось по 5 наблюдений, случайно выбранных из основного массива, затем по этому дополненному массиву вновь производилась оценка уравнения. Далее из такого дополненного массива удалялись 5 случайно выбранных наблюдений. В результате объём подмассива вновь возвращался к исходному. И вновь производилась оценка уравнений логистической регрессии. Что же показали эти эксперименты? Они показали, что
оценки уравнений, полученных по массивам столь малых объёмов, весьма
неустойчивы. Т.е. в уравнениях, получаемых после добавления и удаления 5
наблюдений, не обнаруживается воспроизводимости состава набора предикторов. Применяя
полученные таким образом уравнения для прогноза, используя для этой цели наблюдения,
не входившие в подмассив по которому оценивали параметры уравнения, были
получены показатели конкордации равные примерно 33%, а не 95-99%. Т.е.
фактически наблюдалось равномерное случайное распределение этих наблюдений в
три подгруппы зависимой переменной.
Все
эти результаты говорят о том, что число наблюдений, число анализируемых
переменных и число градаций дискретных признаков должны определяться заранее
ещё на этапе разработки программы подобных исследований. Для чего и требуется
участие в этом процессе профессионального биостатистика. Об этом и считают разные учёные из Франции, Германии, Испании и Италии.
Следующий массив,
созданный кардиологом О.П., включает более 300 признаков.
Среди многих задач по анализу этого массива, одной из наиболее
интересных была задача оценки уравнения логит-регрессии для признака VAR4A=«Смерть
в период настоящей госпитализации». Данный
признак имеет 2 градации: 1='нет', 2='да'. Для этого признака было получено
несколько десятков уравнений, которые обеспечивали показатель конкордации в
интервале 80-99%.
При оценке уравнений логит-регрессии по массивам с большим списком потенциальных предикторов, имеется возможность оценки столь же большого набора таких уравнений. Это обусловлено тем, что состав потенциальных предикторов можно целенаправленно регулировать. Для этого нужно вначале оценить все парные связи между зависимым признаком и всеми остальными потенциальными предикторами. Далее отобрать в качестве потенциальных предикторов только те признаки, которые имеют статистически значимые связи с зависимым показателем. Другой подход к формированию списка потенциальных предикторов связан с возможностями реального изменения значений предикторов, вошедших в уравнение для целенаправленного увеличения вероятности нужного исхода. Например, в данном массиве таким исходом для признака VAR4A=«Смерть в период настоящей госпитализации» будет исход «нет». Следующий подход к выбору списка потенциальных предикторов заключается в последовательном отборе предикторов ранее вошедших в уравнение логит-регрессии, и при этом имеющих максимальные значения модулей стандартизованных коэффициентов регрессии. Не меньшую важность имеет и тактика окончательного отбора наиболее интересных уравнений логит-регрессии из некоторого набора таких уравнений. Напомним, что каждое уравнение позволяет вычислить вероятности отнесения всех наблюдений в отдельные подгруппы зависимого признака. При этом наблюдение относится в ту подгруппу, для которой вероятность, вычисленная по уравнению, максимальна. Рассмотрим случай бинарной
логит-регрессии, обозначив вероятность отнесения наблюдения к первой подгруппе
через р1, а ко второй подгруппе – р2. Для некоторого
наблюдения получены две вероятности: р1=0,4461 ; р2=0,5539. В этом случае наблюдение будет
отнесено ко второй подгруппе. Однако это же решение будет принято и для другого
случая: р1=0,0461 ; р2=0,9539. Очевидно, что во втором случае
решение об отнесении данного наблюдения ко второй подгруппе более надёжно,
нежели в первом случае. Имея в своём распоряжении вычисленные вероятности
отнесения к обеим подгруппам для разных вариантов уравнений, несложно оценить
средние вероятности отнесения к каждой подгруппе. Далее провести сравнение этих
средних для одной и тоже подгруппы, но полученные по разным уравнениям. Далее
можно сравнить дисперсии этих оценок и т.д. Т.е. вычисленные вероятности могут
быть использованы для сравнения уравнений между собой и выбора более
привлекательных уравнений.
Далее: 3. Логистическая регрессия. Примеры анализа реальных данных. |
... стоимость заявок по НЦ БИОСТАТИСТИКА выполняет работы по статистическому анализу экспериментальных данных уже более 30 лет. В его составе исследователи России, США, Израиля, Англии, Канады и других стран. Услугами НЦ пользуются аспиранты и докторанты в области медицины, биологии, социологии, психологии и т.д. (См. далее ) Предложения зарубежных исследователей о важных методах статистического анализа Начиная с 2010 года зарубежные исследователи по медицине, биологии, и многим иным направлениям, чаще стали обращаться по своим просьбам статистического анализа в наш НЦ БИОМЕТРИКА. Которые затем часто и упоминают о нас в своих статьях. И поэтому для проведения нами статистического анализа они как раз и поддерживают использование предлагаемых им многих сложных многомерных методов анализа. А также использовать для них и многие стандартные парные методы статистического анализа, но уже по более глубоким аспектам. И получая результаты этих сложных методов статистического анализа, эти исследователи как раз и осознают реально сложными свои технологии. Что и позволяет им обнаруживать и устанавливать детали новых улучшений своих технологий. Примеры оформления заказчиками базы данных, описания признаков и целей статистического анализа этой базы данных Пример "ПРОГРАММА РАБОТ по статистическому анализу" базы данных Исследователя. Леонов В.П. ... При этом содержание подобных "ПРОГРАММ..." определяются приводимыми 5-ю деталями. ... В данном примере "ПРОГРАММЫ..." приводится 22 БЛОКА по конкретным методам анализа и графикам. НЦ БИОСТАТИСТИКА Отзывы исследователей по НАУКОМЕТРИКА СТАТИСТИЧЕСКОЙ ПАРАДИГМЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОМЕДИЦИНЫ (ПО МАТЕРИАЛАМ ПУБЛИКАЦИЙ). В.П.Леонов. Вестник Томского государственного университета. Серия "Математика. Кибернетика. Информатика". №275. АПРЕЛЬ 2002, стр. 17-24. СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ДАННЫХ ДЛЯ МЕДИКОВ И БИОЛОГОВ (время и опыт). Три "Почему ..." и пять принципов описания статистики в биомедицинских публикациях. Почему появилась эта статья? Леонов В.П. Общие проблемы применения статистики в биомедицине. Леонов В.П. Ошибки статистического анализа биомедицинских данных. Доклад на научно-практическая конференция "Роль эпидемиологических и клинических исследований в здравоохранении: планирование, организация, внедрение результатов в практику", посвящённая памяти доктора медицинских наук, профессора В.П. Алексеева в Якутске (12-13 ноября 2009). Применение статистики в статьях и диссертациях по медицине и биологии. Часть I. Описание методов статистического анализа в статьях и диссертациях. Международный журнал медицинской практики, 1998 г., вып. 4. В.П. Леонов, П.В. Ижевский ПРИМЕНЕНИЕ СТАТИСТИКИ В СТАТЬЯХ И ДИССЕРТАЦИЯХ ПО МЕДИЦИНЕ И БИОЛОГИИ. ЧАСТЬ III. ПРОБЛЕМЫ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ "АВТОР - РЕДАКЦИЯ - ЧИТАТЕЛЬ". Леонов В.П. Применение статистики в статьях и диссертациях по медицине и биологии. Часть IV. Наукометрия статистической парадигмы экспериментальной биомедицины. Международный журнал медицинской практики, 2002 г. вып. 3. Леонов В.П. Леонов В.П. Ошибки статистического анализа биомедицинских данных. Международный журнал медицинской практики, 2007, вып. 2, стр.19-35. Камуфляжные мемы инфоценоза научных школ // Философия математики: актуальные проблемы. Материалы Международной научной конференции 15-16 июня 2007. Москва, Изд. Саван С. А., 2007. - с. 212-216. Леонов В.П. Доклад "Почему и как надо учить медиков статистике?" Леонов В. П. Доклад на международной конференции по доказательной медицине в Ереване 18-20.10.2012 Зачем нужна статистика в доказательной медицине? В. Леонов. Армянский медицинский реферативный журнал, 2012, вып. 9, с. 184-193. Сравниваем средние, а также и ... В. Леонов Проценты - статистический анализ? Или проценты - арифметический анализ? В. Леонов. Примеры отличных диссертаций и статей по медицине и биологии, с нашими результатами статистического анализа Д.С. Симанков. Применение метода логистической регрессии для факторов риска, влияющих на исход операции в условиях искусственного кровообращения В.В. Половинкин ТОТАЛЬНАЯ МЕЗОРЕКТУМЭКТОМИЯ — ФАКТОР ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ЛЕЧЕНИЯ СРЕДНЕАМПУЛЯРНОГО И НИЖНЕАМПУЛЯРНОГО РАКА ПРЯМОЙ КИШКИ. И.А. Бирюкова Научно - практическая работа " ФАРМАКОЭКОНОМИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ РОЗНИЧНОГО РЫНКА ГОРОДА ОМСКА" Н.П. Гарганеева КЛИНИКО-ПАТОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ ФОРМИРОВАНИЯ ПСИХОСОМАТИЧЕСКИХ СООТНОШЕНИЙ ПРИ ЗАБОЛЕВАНИЯХ ВНУТРЕННИХ ОРГАНОВ И ПОГРАНИЧНЫХ ПСИХИЧЕСКИХ РАССТРОЙСТВАХ автореферат диссертации на соискание учёной степени доктора медицинских наук) А.Г. Сыркина Ретроспективный анализ эффективности и безопасности тромболитической терапии острого инфаркта миокарда у больных пожилого и старческого возраста (диссертация на соискание учёной степени кандидата медицинских наук). А.Н. Рудаков Дифференцированный подход к проведению профилактики язв желудка и двенадцатиперстной кишки у больных ишемической болезнью сердца, принимающих аспирин. (автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата медицинских наук) Г.Б. Кривулина Влияние велотренировок различной продолжительности на дисфункцию эндотелия и факторы риска атеросклероза у молодых мужчин (автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата медицинских наук) Л.В. Сутурина Гипоталамический синдром: основные звенья патогенеза, диагностика, патогенетическая терапия и прогноз (автореферат диссертации на соискание учёной степени доктора медицинских наук) В. Леонов. Цели, возможности, и проблемы использования биостатистики в доказательной медицине. Доклад на Конференции по доказательной медицине в Ереване «От доказательной медицины к доказательному здравоохранению» (24 - 26 сентября 2015 года). Фоторепортаж с Конференции по доказательной медицине в Ереване. Фоторепортаж с семинара по биометрике в Ереване, прошедшего после конференции по доказательной медицине (24 - 26 сентября 2015 года). Отзывы слушателей семинара по биометрике в Ереване в сентябре 2015 г. Новые полезные книги... (Заказать книгу можно через издательство) Ланг Т., Сесик М. Как описывать статистику в медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2016 - 480 с. Актуальность этого издания весьма велика. По-прежнему в биомедицинских статьях и диссертациях публикуется масса статистических нелепостей, как образцы "статистического самоудовлетворения" и "статистического макияжа". Например, в двух диссертациях, выполненных в 2014 и 2015 гг. в Алтайском медуниверситете по разным специальностям, но при этом в полностью идентичных описаниях, состоящих из 94 слов, написано следующее. «Полученные данные были статистически обработаны с использованием программ Microsoft Offis Exel 2007. Достоверность различий между средними величинами определяли с помощью критерия значимости Стьюдента (t). Нормальность распределений в группах оценивали по критерию Шапиро-Уилка». Далее сообщается об использовании критерия Манна-Уитни, и т.д. Очевидно, что под Offis Exel авторы подразумевали Office Excel. Сложнее было бы об этом догадаться, если бы авторы написали Offis Exul. Вывод: оба диссертанта, как и члены двух диссертационных советов, не знают многого, в том числе описанного в этой книге. Например, не знают того, что в пакете Office Excel нет критериев Шапиро-Уилка и Манна-Уитни. Данная книга обучит правильно и хорошо описывать и понимать результаты статистического анализа. Поэтому исследователи станут более качественно выполнять статистический анализ, получая правильную технологию лечения пациентов. Что в результате будет снижать смертность населения, а также себестоимость лечебных процедур. Приложение к русскому изданию книги «Как описывать статистику в
медицине. Руководство для авторов, редакторов и рецензентов».
На файле "Поиски методов или результатов статистического анализа" сообщается, что сейчас на сайте БИОМЕТРИКА размещено 4162 htm-файлов, 651 pdf-файлов, 152 djvu-файлов, и т.д. И там же приводятся описания групп конкретных файлов. В частности по методам статистического анализа, их отличным результатам, отзывам авторов, книгам этих методов, статистике посещаемости сайта БИОМЕТРИКА, и т.д. Далее приведено подробное пояснение поиска нужных файлов системой Google, которая там же и помещена. А после системы Google размещены популярные 341 htm-адресов и 79 адресов pdf-адресов. Итак, для оперативного выбора конкретного нужного файла на данном сайте БИОМЕТРИКА , рекомендую перейти на файл "Поиски методов или результатов статистического анализа". Новые полезные книги... Петри А., Сэбин К. Наглядная медицинская статистика. Учебное пособие. 3-е издание. Пер. с англ. В.П. Леонова. 2015. - 216 с. Предыдущие издания оригинала этой книги были опубликованы в 2000, 2005 и 2009 гг. Третье издание книги, как и два предыдущих, имеет целью донести до читателя основные понятия и принципы медицинской статистики, которые достаточно широко используются зарубежными медиками и биологами. Книга содержит необходимую теоретическую часть, а также в доступной форме даёт практическое описание того, как могут применяться статистические методы в реальных клинических исследованиях. Низкий уровень использования статистики в отечественной медицинской науке является одной из основных причин, по которым уже 111 лет Нобелевские премии по медицине не присуждаются россиянам. Ценность этой книги для медицинской науки определяется и проводимой в России реформой отечественной науки, в том числе реформой ВАК и системы научной аттестации. Учебное пособие предназначено для студентов, аспирантов и докторантов медицинских вузов, биологических факультетов университетов, врачей, исследователей-клиницистов и всех, кто является сторонником доказательной медицины. Банержи А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс. Издательство "Практическая медицина", 2014. - 287 с. Пер. с англ. В.П. Леонова. Т. Гринхальх. Основы доказательной медицины. Издательство "ГЭОТАР-Медиа", 2015. - 336 с. 4-е издание переработанное и дополненное. Пер. с англ. Под ред. И.Н. Денисова, К.И. Сайткулова, В.П. Леонова. Послушать и скачать... При многочисленной работе с описаниями статистических процедур, и т.д., реально появляется усталость. И для улучшения дальнейшей работы можно прослушать хорошие песни и музыку, увидев при этом также интересные видео. В указанной вверху ссылке приведены много разных вариантов видео-песен с сообщениями о Томске и о Томском государственном университете. А также очень много видео-песен с Анной Герман. И с остальными певцами: Мария Максакова, Лев Лещенко, Юрий Антонов, Игорь Скляр, Валерий Ободзинский, Владимир Трошин, Галина Хомчик, Виктория Иванова, Юрий Кукин, Олег Митяев, Юрий Визбор, Юрий Кукин, и т.д. Можно прослушать и скачать используемые при этом видео-файлы *.mp4, применив для этого программу Ummy Video Downloader. Логистическая регрессия
в медицине и биологии. В серии 10 статей рассмотрены основы метода логистической регрессии. На многочисленных примерах анализа реальных массивов данных поясняется специфика использования данного метода. Приведены многочисленные уравнения логистической регрессии и ROC-кривых, полученные при анализе реальных данных. 1. Логистическая регрессия. Основные понятия и возможности метода. КУНСТКАМЕРА. Обзор большой коллекции медицинских статей и диссертаций с существенными ошибками и нелепыми использованиями и описаниями методов статистики. Экспозиция 1 Экспозиция 2 Экспозиция 3 Экспозиция 4 Экспозиция 5 Экспозиция 6 Для удобства работы с экспонатами они отсортированы по фамилиям авторов, городам, в которых проживают авторы, и по организациям, в которых работают авторы, а также по научным специальностям. Новый экспонат КУНСTКАМЕРЫ - Диссертация "Сравнительная характеристика показателей кардиореспираторной системы спортсменов и лиц, не занимающихся спортом, в условиях северного промышленного города", Тюменский государственный университет, Тюмень - 2006 г. Новый экспонат КУНСTКАМЕРЫ - Диссертация «Анализ полиморфизма генов сердечно-сосудистой системы и системы детоксикации в различных возрастных группах Санкт-Петербурга». Обсуждаемая диссертация являет собой ярчайший пример того, какую злую шутку может сыграть с автором игнорирование проблемы множественных сравнений при статистическом анализе полученных данных. Леонов В.П. Ошибки статистического анализа биомедицинских данных. Международный журнал медицинской практики, 2007, вып. 2, стр.19-35. Когда нельзя, но очень хочется,
или
Ещё раз о критерии Стьюдента. Статистика в кардиологии. 15 лет спустя. Журнал "Медицинские технологии. Оценка и выбор", 2014, №1, с. 17-28. Леонов В.П. Отзывы читателей обзора "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". В ноябре 2013 г. был опубликован наш обзор "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". За прошедшие полгода более 20 читателей этого обзора прислали нам свои отзывы по нему. Далее приведены фрагменты из двух отзывов, и наши комментарии к ним... НАУКОМЕТРИКА СТАТИСТИЧЕСКОЙ ПАРАДИГМЫ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ БИОМЕДИЦИНЫ (ПО МАТЕРИАЛАМ ПУБЛИКАЦИЙ). В.П.Леонов. Вестник Томского государственного университета. Серия "Математика. Кибернетика. Информатика". №275. АПРЕЛЬ 2002, стр. 17-24. СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ДАННЫХ ДЛЯ МЕДИКОВ И БИОЛОГОВ (время и опыт). Три "Почему ..." и пять принципов описания статистики в биомедицинских публикациях. Почему появилась эта статья? Леонов В.П. Общие проблемы применения статистики в биомедицине. ВАК для учёных? или ВАК для… бумагомарак? «ТРОИЦКИЙ ВАРИАНТ» № 8 (127), 2013 год. ". Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты. ДОКАЗАТЕЛЬНАЯ МЕДИЦИНА И СТАТИСТИКА. КРАТКОСТЬ – СЕСТРА ТАЛАНТА? ИЛИ ПРИЗНАК НЕЗНАНИЯ? ПРОЦЕНТЫ – ПРИМИТИВНО? ЗАТО ДОСТУПНО! СТАТИСТИЧЕСКАЯ ВАМПУКИЗАЦИЯ, ОНА ЖЕ ВСЕОБЩАЯ СТЬЮДЕНТИЗАЦИЯ. «ЛОШАДЕНДУС СВАЛЕНДУС С МОСТЕНДУС». ЗЕММЕЛЬВЕЙС И СТАТИСТИЧЕСКАЯ ТЕХНИКА БЕЗОПАСНОСТИ. «ЗАЧЕМ НАМ КУЗНЕЦ? НАМ КУЗНЕЦ НЕ НУЖЕН». Весь обзор одним файлом Отзывы читателей обзора Статистика в кардиологии. 15 лет спустя. В ноябре 2013 г. был опубликован наш обзор "Статистика в кардиологии. 15 лет спустя". За прошедшие полгода более 20 читателей этого обзора прислали нам свои отзывы по нему. Далее приведены фрагменты из двух отзывов, и наши комментарии к ним... Когда нельзя, но очень хочется,
или
Ещё раз о критерии Стьюдента. За те несколько лет, что прошли с момента публикации этой статьи,
а также статей "В
новый век - с доказательной биомедициной" (ПОИСК, N 20 (522)
21 мая 1999) и "Куплю
500 диссертаций! (Медицинская Газета N10 за 14.02.2001)", практически
ничего не изменилось. Да, в России стали писать и говорить о доказательной
медицине, проводить конференции по этой тематике, а в некоторых
медицинских вузах даже открыли центры доказательной медицины. Однако
откроем биомедицинские журналы и диссертации, и станет ясно, что
это не более чем дань моде...
|
На файле "Поиски методов или результатов статистического анализа" сообщается, что сейчас на сайте БИОМЕТРИКА размещено 4162 htm-файлов, 651 pdf-файлов, 152 djvu-файлов, и т.д. И там же приводятся описания групп конкретных файлов. В частности по методам статистического анализа, их отличным результатам, отзывам авторов, книгам этих методов, статистике посещаемости сайта БИОМЕТРИКА, и т.д. Далее приведено подробное пояснение поиска нужных файлов системой Google, которая там же и помещена. А после системы Google размещены популярные 341 htm-адресов и 79 адресов pdf-адресов. Итак, для оперативного выбора конкретного нужного файла на данном сайте БИОМЕТРИКА , рекомендую перейти на файл "Поиски методов или результатов статистического анализа". |
Наш адрес Сайт БИОМЕТРИКА создан в 1997 г. © Василий Леонов
Доказательная или сомнительная? Медицинская наука Кузбасса: статистические аспекты.
Пример "ПРОГРАММА РАБОТ по статистическому анализу" базы данных Исследователя
Доклад "Почему и как надо учить медиков статистике?" В. Леонов.