Логистическая регрессия в медицине и биологии. Леонов В.

В серии из 10 статей рассмотрены основы метода логистической регрессии. Приведены многочисленные уравнения логистической регрессии и ROC-кривых, полученные при анализе реальных данных.

Введение

1. Логистическая регрессия. Основные понятия и возможности метода.
2. Логистическая регрессия. Анализ массивов большой размерности.
3. Логистическая регрессия. Примеры анализа реальных данных.
4. Логистическая регрессия и ROC-анализ.
5.Особенности логистической регрессии в акушерстве.
6.Особенности логистической регрессии в психиатрии, психологии и социологии.
7. Пример использования логистической регрессии для расчёта прогноза исхода оперативного лечения.
8. Логистическая регрессия  - "вершина пирамиды". А в "фундаменте" - что?
9. Как повысить качество логистической регрессии.

Предложения зарубежных исследователей о важных методах статистического анализа

  Начиная с 2010 года зарубежные исследователи по медицине, биологии, и многим иным направлениям, чаще стали обращаться по своим просьбам статистического анализа в наш НЦ БИОМЕТРИКА. Которые затем часто и упоминают о нас в своих статьях. И поэтому для проведения нами статистического анализа они как раз и поддерживают использование предлагаемых им многих сложных многомерных методов анализа. А также использовать для них и многие стандартные парные методы статистического анализа, но уже по более глубоким аспектам. И получая результаты этих сложных методов статистического анализа, эти исследователи как раз и осознают реально сложными свои технологии. Что и позволяет им обнаруживать и устанавливать детали новых улучшений своих технологий.

В. Леонов. Цели, возможности, и проблемы использования биостатистики в доказательной медицине. Доклад на Конференции по доказательной медицине в Ереване «От доказательной медицины к доказательному здравоохранению» (24 - 26 сентября 2015 года).

Фоторепортаж с Конференции по доказательной медицине в Ереване.

Фоторепортаж с семинара по биометрике в Ереване, прошедшего после конференции по доказательной медицине.

Отзывы слушателей семинара по биометрике в Ереване в сентябре 2015 г.

Статистика в кардиологии. 15 лет спустя. Журнал "Медицинские технологии. Оценка и выбор", 2014, №1, с. 17-28. Леонов В.П.

Отзыв

Д.В. Гражданкиной, Новосибирск

Уважаемые диссертанты!

    Статистический анализ данных необходим для любой медицинской статьи или диссертации. Когда я составила базу данных по своему исследованию, то встал вопрос о том, каким образом провести сравнение множества показателей в разных подгруппах. Читала книги О.Ю. Ребровой и С. Гланца по статистике в медицине. Разобраться в различных методах статистического анализа оказалось интересной и достаточно сложной задачей, поэтому стало понятно, что без помощи профессионального статистика не обойтись. Кроме того, при чтении статей, посвященных серьёзным исследованиям в медицинских журналах с высоким импакт-фактором, я обращала внимание на то, что полученные в них выводы основаны на результатах многофакторных методов анализа.

    Совершенно случайно в интернете нашла сайт Биометрика с кладезью полезной информации по статистике и контактами Леонова Василия Петровича. Прочитав отзывы других исследователей, я решила обратиться за помощью к Василию Петровичу по электронной почте и в тот же день получила ответ.
По моей базе данных оперативно (в течение нескольких дней) была составлена программа работ, включавшая несколько десятков пунктов с учётом поставленной цели и задач исследования. Согласование программы проходило по электронной почте и по скайпу в удобное время. Василий Петрович доступно и подробно объяснил суть каждого пункта программы, показал некоторые результаты в качестве примера на экране.

   В ходе согласования программы можно удалить часть её пунктов или, наоборот, добавить другие методы анализа. После окончательного утверждения программы, я очень оперативно получала результаты проведенного исследования, в том числе, в виде графиков, по электронной почте. Они обсуждались по скайпу в удобное время. Вопросы по полученным результатам лучше готовить заранее. Также по каждому пункту программы были отправлены файлы с пояснениями, как правильно интерпретировать и описывать полученные данные. И еще были высланы книги по статистике с доступным изложением материала. Каждый раз в электронном письме я получала и музыку, что было особенно приятно, так как музыкальные вкусы с Василием Петровичем у нас во многом совпадают.

  Для себя я впервые открыла метод логистической регрессии, который подробно и, самое главное, доступно описан Василием Петровичем в 10 статьях, выложенных на сайте БИОМЕТРИКА. Данный метод достаточно продуктивный и сложный, с его помощью может создаваться несколько десятков уравнений. Из них я выбрала несколько уравнений с наибольшей предсказательной ценностью и практической значимостью. Вопросов по данному методу анализа в ходе работы было много, на которые Василий Петрович давал чёткие ответы с пояснениями в электронных письмах. С помощью данного метода были получены результаты, ценные для клинической практики.

   Обстоятельства у меня сложились так, что написание кандидатской диссертации  растянулось на продолжительное время. Вначале необходимо было оценить первичные результаты по собранным данным, а примерно через 10 лет наблюдения оценивались неблагоприятные исходы и факторы, которые на эти исходы повлияли. Поэтому по моей базе данных была составлена не одна, а несколько программ работ. И, тем самым, еще более важные и ценные результаты были получены.

    Большое спасибо Василию Петровичу и его коллегам за проделанную работу и полученные ценные результаты, за длительный период консультирования по возникающим вопросам, за великолепное сотрудничество и за знания, приобретенные по медицинской статистике, позволяющие по-новому читать результаты других исследователей. Отдельная благодарность за благоприятные условия, создаваемые во время совместной работы.

     Совет другим исследователям – планировать свою работу с медицинским статистиком заранее, до начала сбора материала по теме исследования, чтобы, например, не допустить ошибок с объёмом выборки. А также, тщательно продумывать состав предикторов для уравнений логистической регрессии

   Работаю я ассистентом кафедры эндокринологии Новосибирского медуниверситета. Моё исследование посвящено изучению роли предшественника мозгового натрийуретического пептида в ранней диагностике хронической сердечной недостаточности при сахарном диабете 2 типа. Вопрос о том, как и кому выполнять статистический анализ данных для диссертаций, статей по медицине, волновал меня довольно давно.   

   Во-первых, потому что я не проходила даже минимального обучения статистике. Пыталась, правда, самостоятельно освоить программу Statistica 6.0 по книге Ребровой О.Н., однако, уверенности в правильности полученных мною результатов не было. Во-вторых, при прочтении зарубежных статей по медицине мне были совершенно непонятны те методы статистического исследования, которые в них использовались и далее подробно обсуждались (в частности, логистическая регрессия, ROC-анализ, множественный линейный регрессионный анализ, многофакторный анализ ANOVA и т.д.). Постепенно пришла к выводу, что грамотный статистический анализ данных может выполнить только специалист в этой области.

    Однако в силу сложившихся в моей жизни обстоятельств (ушла в отпуск по уходу за ребенком, резко ограничились контакты с людьми), я не знала, где такого специалиста найти. И вдруг совершенно случайно вышла на сайт БИОМЕТРИКА «www.biometrica-tomsk.ru». Как оказалось, не зря. Знакомство с сайтом и его редактором было, пожалуй, для меня лучшим новогодним подарком.

    Профессионализм руководителя центра Леонова В.П. и его коллег трудно переоценить. Общение по электронной почте оказалось лёгким, я практически сразу получала ответы на свои письма (ожидание каждого письма не затягивалось более чем на 30 минут). Сначала мы вместе с Василием Петровичем согласовали программу работ по моему массиву данных. Она была составлена за несколько дней, и затем мы очень подробно обсудили её по Cкайпу, останавливаясь на непонятных мне вопросах. Анализ данных для моей кандидатской диссертации был выполнен менее, чем за 3 недели - 52 файла с ценной информацией! Я даже не ожидала получить столько результатов, причём некоторые из них оказались открытием.

    До начала анализа данных мне были высланы несколько книг с подробным и ясным описанием тех методов исследования, которые использовались в работе (логистическая регрессия, анализ таблиц сопряжённости, множественная линейная регрессия, дисперсионный анализ ANOVA, и т.д.). Благодаря этим книгам, понимание результатов значительно облегчилось. Все возникавшие вопросы обсуждались в Скайпе в удобное для меня время. А ещё мне подарили много хорошей музыки, что не менее приятно, чем удовлетворение результатами собственного исследования.

    Перед тем, как заказывать анализ данных для своей работы, просмотрите ещё раз (даже несколько раз) очень внимательно свой массив и проработайте его. Возможно, это займет много времени, но потом Вы не будете жалеть о том, что не доделали что-либо и Вам, возможно, не придется согласовывать новую программу работ. Чётко определите цели и задачи исследования и, по-возможности, обговорите их со своим научным руководителем. И ещё: ознакомьтесь со статьями, опубликованными на сайте БИОМЕТРИКА (особенное внимание уделите статье по логистической регрессии). Это необходимо затем, чтобы согласование Вашей программы работ произошло как можно быстрее и продуктивнее.

    И не бойтесь, что ничего не поймете, когда получите результаты, они высылаются с пояснениями, с которыми необходимо внимательно ознакомиться. Всегда можно получить подробную консультацию по Скайпу (только обязательно заранее сформулируйте свои вопросы, отправив их предварительно Леонову В.П. для более продуктивной работы).

    Огромное спасибо всем сотрудникам центра «Биостатистика» за быстрое и качественное выполнение статистического анализа данных!

    Считаю, что только такое сотрудничество медиков и биостатистиков позволит повысить уровень отечественных научных исследований, сделать их цитируемыми в мировом медицинском сообществе.

Гражданкина Д.В., ассистент кафедры эндокринологии НГМУ, Новосибирск.